
包索引
-
igraph_options()
igraph_opt()
- igraph 包的参数
-
with_igraph_opt()
- 使用临时 igraph 选项设置运行代码
-
connect()
ego_size()
neighborhood_size()
ego()
neighborhood()
make_ego_graph()
make_neighborhood_graph()
- 图顶点的邻域
-
make_()
- 创建一个新图
-
make_chordal_ring()
chordal_ring()
- 创建扩展的弦环图
-
make_clusters()
- 创建一个社团对象。
-
make_empty_graph()
empty_graph()
- 一个没有边的图
-
make_from_prufer()
from_prufer()
- 从其 Prüfer 序列创建一个无向树图
-
make_full_citation_graph()
full_citation_graph()
- 创建一个完整的(完全)引用图
-
make_full_graph()
full_graph()
- 创建一个完整图
-
make_graph()
make_directed_graph()
make_undirected_graph()
directed_graph()
undirected_graph()
- 从边列表或著名图创建一个 igraph 图
-
make_lattice()
lattice()
- 创建晶格图
-
make_ring()
ring()
- 创建一个环图
-
make_star()
star()
- 创建一个星图,一个具有 n 个顶点和 n - 1 个叶子的树
-
make_tree()
tree()
- 创建树图
-
realize_degseq()
- 从给定的度序列确定性地创建一个图
-
realize_bipartite_degseq()
实验性 - 从两个度序列确定性地创建一个二分图
-
graph_from_atlas()
atlas()
- 从图谱创建图
-
graph_from_edgelist()
from_edgelist()
- 从边列表矩阵创建一个图
-
graph_from_literal()
from_literal()
- 通过简单接口创建(小)图
-
graph_()
- 将对象转换为图
-
graph_from_lcf()
- 从 LCF 符号创建图
-
as_data_frame()
graph_from_data_frame()
from_data_frame()
- 从数据框创建 igraph 图或反之
-
sample_()
- 从随机图模型中采样
-
sample_bipartite()
bipartite()
已弃用 - 二分随机图
-
sample_chung_lu()
chung_lu()
实验性 - 具有给定预期度的随机图
-
sample_correlated_gnp()
- 通过随机添加/删除边从给定图生成一个新的随机图
-
sample_correlated_gnp_pair()
- 采样一对相关的 \(G(n,p)\) 随机图
-
sample_degseq()
degseq()
- 生成具有给定度序列的随机图
-
sample_dot_product()
dot_product()
- 根据随机点积图模型生成随机图
-
sample_fitness()
- 来自顶点适应度分数的随机图
-
sample_fitness_pl()
- 来自顶点适应度分数的无标度随机图
-
sample_forestfire()
- 森林火灾网络模型
-
sample_gnm()
gnm()
- 根据 \(G(n,m)\) Erdős-Rényi 模型生成随机图
-
sample_gnp()
gnp()
- 根据 \(G(n,p)\) Erdős-Rényi 模型生成随机图
-
sample_grg()
grg()
- 几何随机图
-
sample_growing()
growing()
- 生长随机图生成
-
sample_hierarchical_sbm()
hierarchical_sbm()
- 采样分层随机块模型
-
sample_islands()
- 具有子图的图,每个子图都是一个随机图。
-
sample_k_regular()
- 创建一个随机正则图
-
sample_last_cit()
last_cit()
sample_cit_types()
cit_types()
sample_cit_cit_types()
cit_cit_types()
- 随机引用图
-
sample_pa()
pa()
- 使用优先连接生成随机图
-
sample_pa_age()
pa_age()
- 生成具有优先连接和老化的演化随机图
-
sample_pref()
pref()
sample_asym_pref()
asym_pref()
- 基于特征的随机生成
-
sample_sbm()
sbm()
- 采样随机块模型
-
sample_smallworld()
smallworld()
- Watts-Strogatz 小世界模型
-
sample_traits_callaway()
traits_callaway()
sample_traits()
traits()
- 基于不同顶点类型的图生成
-
sample_tree()
- 随机且均匀地采样树
-
make_()
- 创建一个新图
-
sample_()
- 从随机图模型中采样
-
simplified()
- 构造函数修饰符,用于删除多个和循环边
-
with_edge_()
- 构造函数修饰符,用于添加边属性
-
with_graph_()
- 构造函数修饰符,用于添加图属性
-
with_vertex_()
- 构造函数修饰符,用于添加顶点属性
-
without_attr()
- 构造函数修饰符,用于从图中删除所有属性
-
without_loops()
- 构造函数修饰符,用于删除循环边
-
without_multiples()
- 构造函数修饰符,用于删除多个边
-
as.igraph()
- 转换为 igraph
-
add_layout_()
- 向图中添加布局
-
component_wise()
- 分量布局
-
layout_as_bipartite()
as_bipartite()
- 二分图的简单两行布局
-
layout_as_star()
as_star()
- 生成坐标以将图的顶点放置在星形中
-
layout_as_tree()
as_tree()
- Reingold-Tilford 图布局算法
-
layout_in_circle()
in_circle()
- 顶点位于圆上的图布局。
-
layout_nicely()
nicely()
- 自动选择合适的图布局算法
-
layout_on_grid()
on_grid()
- 简单网格布局
-
layout_on_sphere()
on_sphere()
- 顶点位于球体表面的图布局
-
layout_randomly()
randomly()
- 将顶点随机放置在平面或 3D 空间中
-
layout_with_dh()
with_dh()
- Davidson-Harel 布局算法
-
layout_with_fr()
with_fr()
- Fruchterman-Reingold 布局算法
-
layout_with_gem()
with_gem()
- GEM 布局算法
-
layout_with_graphopt()
with_graphopt()
- graphopt 布局算法
-
layout_with_kk()
with_kk()
- Kamada-Kawai 布局算法
-
layout_with_lgl()
with_lgl()
- 大型图布局
-
layout_with_mds()
with_mds()
- 通过多维缩放进行图布局
-
layout_with_sugiyama()
with_sugiyama()
- Sugiyama 图布局生成器
-
norm_coords()
- 规范化用于绘制图的坐标
-
normalize()
- 规范化布局
-
layout_with_drl()
with_drl()
- DrL 图布局生成器
-
categorical_pal()
- 类别的调色板
-
diverging_pal()
- 发散调色板
-
r_pal()
- 默认的 R 调色板
-
sequential_pal()
- 顺序调色板
-
plot(<igraph>)
- 图的绘制
-
rglplot()
- 使用 OpenGL 绘制 3D 图
-
plot_dendrogram(<igraphHRG>)
- HRG 树状图绘制
-
plot_dendrogram()
- 社团结构树状图绘制
-
curve_multiple()
- 绘制图时的最佳边曲率
-
shapes()
shape_noclip()
shape_noplot()
add_shape()
- 绘制 igraph 图时各种顶点形状
-
vertex.shape.pie
- 在图绘制中使用饼图作为顶点
-
align_layout()
- 对齐顶点布局 此函数将顶点布局居中于坐标系原点,并旋转布局以实现与坐标轴在视觉上令人愉悦的对齐。 对于诸如
layout_with_fr()
等力导向布局,这样做特别有用。
-
greedy_vertex_coloring()
- 贪婪顶点着色
-
add_edges()
- 向图添加边
-
add_vertices()
- 向图中添加顶点
-
complementer()
- 图的补图
-
compose()
- 将两个图组合为二元关系
-
contract()
- 将多个顶点收缩为一个顶点
-
delete_edges()
- 从图中删除边
-
delete_vertices()
- 从图中删除顶点
-
difference()
- 两组的差集
-
disjoint_union()
`%du%`
- 图的不相交并集
-
connect()
ego_size()
neighborhood_size()
ego()
neighborhood()
make_ego_graph()
make_neighborhood_graph()
- 图顶点的邻域
-
`-`(<igraph>)
- 从图中删除顶点或边
-
intersection()
- 两个或多个集合的交集
-
path()
- 沿路径添加或删除边的辅助函数
-
permute()
- 排列图的顶点
-
`+`(<igraph>)
- 将顶点、边或另一个图添加到图中
-
rep(<igraph>)
`*`(<igraph>)
- 多次复制图
-
reverse_edges()
t(<igraph>)
- 反转图中的边
-
union()
- 两个或多个集合的并集
-
union(<igraph>)
- 图的并集
-
vertex()
vertices()
- 用于添加和删除顶点的辅助函数
-
delete_edge_attr()
- 删除边属性
-
delete_graph_attr()
- 删除图属性
-
delete_vertex_attr()
- 删除顶点属性
-
`edge_attr<-`()
- 设置一个或多个边属性
-
edge_attr()
- 查询图的边属性
-
edge_attr_names()
- 列出边属性的名称
-
`graph_attr<-`()
- 设置所有或部分图属性
-
graph_attr()
- 图的图属性
-
graph_attr_names()
- 列出图属性的名称
-
igraph-attribute-combination
attribute.combination
- 当图更改时,igraph 函数如何处理属性
-
`$`(<igraph>)
`$<-`(<igraph>)
- 获取和设置图属性,快捷方式
-
`[[<-`(<igraph.vs>)
`[<-`(<igraph.vs>)
`$`(<igraph.vs>)
`$<-`(<igraph.vs>)
`V<-`()
- 查询或设置顶点序列中顶点的属性
-
set_edge_attr()
- 设置边属性
-
set_graph_attr()
- 设置图属性
-
set_vertex_attr()
- 设置顶点属性
-
set_vertex_attrs()
- 设置多个顶点属性
-
`vertex_attr<-`()
- 设置一个或多个顶点属性
-
vertex_attr()
- 查询图的顶点属性
-
vertex_attr_names()
- 列出顶点属性的名称
-
E()
- 图的边
-
V()
- 图的顶点
-
as_ids()
- 将顶点或边序列转换为普通向量
-
`[`(<igraph.es>)
- 索引边序列
-
`[[`(<igraph.es>)
- 选择边并显示其元数据
-
`[[<-`(<igraph.vs>)
`[<-`(<igraph.vs>)
`$`(<igraph.vs>)
`$<-`(<igraph.vs>)
`V<-`()
- 查询或设置顶点序列中顶点的属性
-
`[`(<igraph.vs>)
- 索引顶点序列
-
`[[`(<igraph.vs>)
- 选择顶点并显示其元数据
-
print(<igraph.es>)
- 将边序列打印到屏幕
-
print(<igraph.vs>)
- 在屏幕上显示顶点序列
-
c(<igraph.es>)
- 连接边序列
-
c(<igraph.vs>)
- 连接顶点序列
-
difference(<igraph.es>)
- 边序列的差
-
difference(<igraph.vs>)
- 顶点序列的差
-
intersection(<igraph.es>)
- 边序列的交集
-
intersection(<igraph.vs>)
- 顶点序列的交集
-
rev(<igraph.es>)
- 反转边序列中的顺序
-
rev(<igraph.vs>)
- 反转顶点序列中的顺序
-
union(<igraph.es>)
- 边序列的并集
-
union(<igraph.vs>)
- 顶点序列的并集
-
unique(<igraph.es>)
- 从边序列中删除重复的边
-
unique(<igraph.vs>)
- 从顶点序列中删除重复的顶点
-
graph_id()
- 获取图的 ID
-
identical_graphs()
- 确定两个图是否相同
-
is_igraph()
- 此对象是 igraph 图吗?
-
is_named()
- 命名图
-
is_weighted()
- 加权图
-
is_chordal()
- 图的弦性
-
as.matrix(<igraph>)
- 将 igraph 对象转换为邻接矩阵或边列表矩阵
-
as_adjacency_matrix()
- 将图转换为邻接矩阵
-
as_biadjacency_matrix()
- 二分图的二分邻接矩阵
-
as_directed()
as_undirected()
- 在有向图和无向图之间转换
-
as_edgelist()
- 将图转换为边列表
-
as_graphnel()
- 将 igraph 图转换为 graph 包中的 graphNEL 对象
-
as_long_data_frame()
- 将图转换为长数据框
-
graph_from_adj_list()
- 从邻接列表创建图
-
as_data_frame()
graph_from_data_frame()
from_data_frame()
- 从数据框创建 igraph 图或反之
-
graph_from_graphnel()
- 将 graph 包中的 graphNEL 对象转换为 igraph
-
head_print()
- 仅打印 R 对象的头部
-
indent_print()
- 缩进打印输出
-
print(<igraph>)
summary(<igraph>)
- 将图打印到终端
-
is_printer_callback()
- 这是一个打印机回调吗?
-
printer_callback()
- 创建打印机回调函数
-
sample_dirichlet()
- 从狄利克雷分布中采样
-
sample_sphere_surface()
- 从球体表面均匀采样向量
-
sample_sphere_volume()
- 从球体体积均匀采样向量
-
convex_hull()
- 一组顶点的凸包
-
running_mean()
- 时间序列的运行平均值
-
sample_seq()
- 采样随机整数序列
-
fit_power_law()
- 将幂律分布函数拟合到离散数据
-
bfs()
- 广度优先搜索
-
constraint()
- Burt 的约束
-
coreness()
- 图的 K 核分解
-
degree()
max_degree()
degree_distribution()
- 顶点的度和度分布
-
dfs()
- 深度优先搜索
-
distance_table()
mean_distance()
distances()
shortest_paths()
all_shortest_paths()
- 顶点之间的最短(有向或无向)路径
-
edge_density()
- 图密度
-
connect()
ego_size()
neighborhood_size()
ego()
neighborhood()
make_ego_graph()
make_neighborhood_graph()
- 图顶点的邻域
-
feedback_arc_set()
- 在图中查找反馈弧集
-
feedback_vertex_set()
实验性 - 在图中查找反馈顶点集
-
girth()
- 图的围长
-
is_acyclic()
- 无环图
-
is_dag()
- 有向无环图
-
k_shortest_paths()
- 查找两个顶点之间的 \(k\) 条最短路径
-
knn()
- 平均最近邻度
-
reciprocity()
- 图的互反性
-
subcomponent()
- 顶点的内分量或外分量
-
topo_sort()
- 图中顶点的拓扑排序
-
transitivity()
- 图的传递性
-
unfold_tree()
- 将通用图转换为森林
-
which_mutual()
- 在有向图中查找互连边
-
cocitation()
bibcoupling()
- 共引用耦合
-
similarity()
- 两个顶点的相似性度量
-
cohesive_blocks()
length(<cohesiveBlocks>)
blocks()
graphs_from_cohesive_blocks()
cohesion(<cohesiveBlocks>)
hierarchy()
parent()
print(<cohesiveBlocks>)
summary(<cohesiveBlocks>)
plot(<cohesiveBlocks>)
plot_hierarchy()
export_pajek()
max_cohesion()
- 计算凝聚块
-
triangles()
count_triangles()
- 在图中查找三角形
-
spectrum()
- 图的邻接矩阵的特征值和特征向量
-
is_chordal()
- 图的弦性
-
max_cardinality()
- 最大基数搜索
-
triangles()
count_triangles()
- 在图中查找三角形
-
transitivity()
- 图的传递性
-
all_simple_paths()
- 列出从一个源的所有简单路径
-
distance_table()
mean_distance()
distances()
shortest_paths()
all_shortest_paths()
- 顶点之间的最短(有向或无向)路径
-
eccentricity()
- 图中顶点的离心率
-
graph_center()
实验性 - 图的中心顶点
-
radius()
- 图的半径
-
bipartite_mapping()
- 确定图是否为二分图
-
is_bipartite()
- 检查图是否具有名为
type
的顶点属性。
-
graph_from_biadjacency_matrix()
- 从二分邻接矩阵创建图
-
as_data_frame()
graph_from_data_frame()
from_data_frame()
- 从数据框创建 igraph 图或反之
-
similarity()
- 两个顶点的相似性度量
-
is_forest()
- 确定图是否为森林。
-
is_tree()
- 确定图是否为树。
-
make_from_prufer()
from_prufer()
- 从其 Prüfer 序列创建一个无向树图
-
sample_spanning_tree()
- 从图的生成树中随机且均匀地采样
-
to_prufer()
- 将树图转换为其 Prüfer 序列
-
mst()
- 最小生成树
-
adjacent_vertices()
- 图中多个顶点的相邻顶点
-
are_adjacent()
- 两个顶点是否相邻?
-
ends()
- 一些图边的关联顶点
-
get_edge_ids()
- 基于边的关联顶点查找边的 ID
-
head_of()
- 图中边的头部
-
incident()
- 图中顶点的关联边
-
incident_edges()
- 图中多个顶点的关联边
-
is_directed()
- 检查图是否有向
-
neighbors()
- 图中的相邻(邻接)顶点
-
`[`(<igraph>)
- 像邻接矩阵一样查询和操作图
-
`[[`(<igraph>)
- 像邻接列表一样查询和操作图
-
tail_of()
- 图中边的尾部
-
arpack_defaults()
arpack()
- ARPACK 特征向量计算
-
alpha_centrality()
- 查找网络位置的 Bonacich alpha 中心性分数
-
betweenness()
edge_betweenness()
- 顶点和边介数中心性
-
closeness()
- 顶点的接近中心性
-
diversity()
- 图多样性
-
eigen_centrality()
- 顶点的特征向量中心性
-
harmonic_centrality()
- 顶点的调和中心性
-
hits_scores()
- Kleinberg 的枢纽和权威中心性分数。
-
authority_score()
hub_score()
- Kleinberg 的权威中心性分数。
-
page_rank()
- Page Rank 算法
-
power_centrality()
- 查找网络位置的 Bonacich 幂中心性分数
-
spectrum()
- 图的邻接矩阵的特征值和特征向量
-
strength()
- 强度或加权顶点度
-
subgraph_centrality()
- 查找网络位置的子图中心性分数
-
centr_betw()
- 根据顶点的介数中心化图
-
centr_betw_tmax()
- 介数中心化的理论最大值
-
centr_clo()
- 根据顶点的接近程度中心化图
-
centr_clo_tmax()
- 接近程度中心化的理论最大值
-
centr_degree()
- 根据顶点的度中心化图
-
centr_degree_tmax()
- 度中心化的理论最大值
-
centr_eigen()
- 根据顶点的特征向量中心性中心化图
-
centr_eigen_tmax()
- 特征向量中心化的理论最大值
-
centralize()
- 图的中心化
-
local_scan()
- 计算图上的局部扫描统计
-
scan_stat()
- 图的时间序列上的扫描统计
-
count_motifs()
- 图模体
-
dyad_census()
- 图的二元组普查
-
motifs()
- 图模体
-
sample_motifs()
- 图模体
-
triad_census()
- 三元组普查,具有三个顶点的子图
-
canonical_permutation()
- 图的规范排列
-
count_isomorphisms()
- 计算两个图之间同构映射的数量
-
count_subgraph_isomorphisms()
- 计算一个图与另一个图的子图之间的同构映射
-
graph_from_isomorphism_class()
- 从同构类创建一个图
-
isomorphic()
is_isomorphic_to()
- 确定两个图是否同构
-
isomorphism_class()
- 图的同构类
-
isomorphisms()
- 计算两个图的顶点之间的所有同构映射
-
subgraph_isomorphic()
is_subgraph_isomorphic_to()
- 确定一个图是否与另一个图的子图同构
-
subgraph_isomorphisms()
- 一个图与另一个图的子图之间的所有同构映射
-
automorphism_group()
- 图的自同构群的生成集
-
count_automorphisms()
- 自同构的数量
-
permute()
- 排列图的顶点
-
match_vertices()
- 给定顶点对应关系的种子匹配图
-
dominator_tree()
- 支配树
-
is_min_separator()
- 最小顶点分隔符
-
is_separator()
- 检查删除此顶点集是否会断开图的连接。
-
max_flow()
- 图中的最大流量
-
min_cut()
- 图中的最小割
-
min_separators()
- 最小大小的顶点分隔符
-
min_st_separators()
- 最小大小的顶点分隔符
-
st_cuts()
- 列出图的所有 (s,t)-割
-
st_min_cuts()
- 列出图的所有最小 \((s,t)\)-割
-
cliques()
largest_cliques()
max_cliques()
count_max_cliques()
clique_num()
largest_weighted_cliques()
weighted_clique_num()
clique_size_counts()
is_clique()
- 查找团的函数,即图中的完整子图
-
is_complete()
- 这是一个完整的图吗?
-
weighted_cliques()
- 用于查找加权团的函数,即图中顶点加权的完全子图
-
graphlet_basis()
graphlet_proj()
graphlets()
- 图的Graphlet分解
-
as_membership()
- 将数值向量声明为成员向量
-
cluster_edge_betweenness()
- 基于边介数的社区结构检测
-
cluster_fast_greedy()
- 通过模块化贪婪优化实现社区结构
-
cluster_fluid_communities()
- 基于交互流体的社区检测算法
-
cluster_infomap()
- Infomap社区发现
-
cluster_label_prop()
- 基于传播标签查找社区
-
cluster_leading_eigen()
- 基于社区矩阵的主特征向量进行社区结构检测
-
cluster_leiden()
- 使用Traag, van Eck & Waltman的Leiden算法查找图的社区结构。
-
cluster_louvain()
- 通过模块化的多层次优化查找社区结构
-
cluster_optimal()
- 最佳社区结构
-
cluster_spinglass()
- 基于统计力学查找图中的社区
-
cluster_walktrap()
- 通过短随机游走实现社区结构
-
membership()
print(<communities>)
modularity(<communities>)
length(<communities>)
sizes()
algorithm()
merges()
crossing()
code_len()
is_hierarchical()
as.dendrogram(<communities>)
as.hclust(<communities>)
cut_at()
show_trace()
plot(<communities>)
communities()
- 用于处理网络社区检测结果的函数
-
compare()
- 使用各种指标比较社区结构
-
groups()
- 顶点划分的组
-
make_clusters()
- 创建一个社团对象。
-
modularity(<igraph>)
modularity_matrix()
- 图的社区结构的模块化
-
plot_dendrogram()
- 社团结构树状图绘制
-
split_join_distance()
- 两个社区结构的分割-连接距离
-
voronoi_cells()
experimental - 图的Voronoi划分
-
feedback_arc_set()
- 在图中查找反馈弧集
-
feedback_vertex_set()
实验性 - 在图中查找反馈顶点集
-
find_cycle()
experimental - 查找图中的环(如果存在)
-
girth()
- 图的围长
-
is_acyclic()
- 无环图
-
is_dag()
- 有向无环图
-
simple_cycles()
experimental - 查找图中的所有简单环。
-
articulation_points()
bridges()
- 图的关节点和桥
-
biconnected_components()
- 双连通分量
-
decompose()
- 将图分解为分量
-
is_biconnected()
experimental - 检查双连通性
-
dim_select()
- 使用剖面似然为奇异值选择维度。
-
embed_adjacency_matrix()
- 邻接矩阵的谱嵌入
-
embed_laplacian_matrix()
- 图的拉普拉斯矩阵的谱嵌入
-
consensus_tree()
- 从多个分层随机图模型创建一致树
-
fit_hrg()
- 拟合分层随机图模型
-
hrg-methods
- 分层随机图
-
hrg()
- 从igraph图创建分层随机图
-
hrg_tree()
- 从分层随机图模型创建igraph图
-
predict_edges()
- 基于分层随机图模型预测边
-
print(<igraphHRG>)
- 将分层随机图模型打印到屏幕
-
print(<igraphHRGConsensus>)
- 将分层随机图一致树打印到屏幕
-
sample_hrg()
- 从分层随机图模型中采样
-
is_degseq()
- 检查度序列对于多重图是否有效
-
is_graphical()
- 度序列是图形化的吗?
-
plot(<sir>)
- 绘制多次SIR模型运行的结果
-
time_bins()
median(<sir>)
quantile(<sir>)
sir()
- 图上的SIR模型
-
random_walk()
random_edge_walk()
- 图上的随机游走
-
igraph_demo()
- 逐步运行igraph演示
-
tkplot()
tk_close()
tk_off()
tk_fit()
tk_center()
tk_reshape()
tk_postscript()
tk_coords()
tk_set_coords()
tk_rotate()
tk_canvas()
- 图的交互式绘图
-
console()
- igraph控制台
-
graph_version()
- igraph数据结构版本
-
upgrade_graph()
- igraph数据结构版本
-
feedback_vertex_set()
实验性 - 在图中查找反馈顶点集
-
find_cycle()
experimental - 查找图中的环(如果存在)
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graph_center()
实验性 - 图的中心顶点
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is_biconnected()
experimental - 检查双连通性
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realize_bipartite_degseq()
实验性 - 从两个度序列确定性地创建一个二分图
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sample_chung_lu()
chung_lu()
实验性 - 具有给定预期度的随机图
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simple_cycles()
experimental - 查找图中的所有简单环。
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voronoi_cells()
experimental - 图的Voronoi划分