从二分邻接矩阵创建图 — graph_from_biadjacency

graph_from_biadjacency_matrix() 从关联矩阵创建一个二分 igraph 图。

用法

graph_from_biadjacency_matrix(
  incidence,
  directed = FALSE,
  mode = c("all", "out", "in", "total"),
  multiple = FALSE,
  weighted = NULL,
  add.names = NULL
)

参数

incidence: 输入的二分邻接矩阵。它也可以是来自 Matrix 包的稀疏矩阵。
directed: 逻辑标量，是否创建有向图。
mode: 一个字符常量，定义有向图中边的方向，对于无向图则忽略。如果为 ‘out’，则边从第一类顶点（对应于二分邻接矩阵中的行）到第二类顶点（关联矩阵中的列）。如果为 ‘in’，则使用相反的方向。如果为 ‘all’ 或 ‘total’，则创建互边。
multiple: 逻辑标量，指定如何解释矩阵元素。请参阅下面的详细信息。
weighted: 此参数指定是否从二分邻接矩阵创建加权图。如果它是 NULL，则创建一个未加权图，并使用 multiple 参数来确定图的边。如果它是一个字符常量，则为每个非零矩阵条目创建一个边，并将该条目的值添加为由 weighted 参数命名的边属性。如果它是 TRUE，则创建一个加权图，并且边属性的名称将是 ‘weight’。
add.names: 一个字符常量，NA 或 NULL。graph_from_biadjacency_matrix() 可以将关联矩阵的行名和列名添加为顶点属性。如果此参数为 NULL（默认值）并且二分邻接矩阵同时具有行名和列名，则这些名称将添加为 ‘name’ 顶点属性。如果您想要为此使用不同的顶点属性，请提供属性的名称作为字符串。如果此参数为 NA，则不会添加任何顶点属性（类型除外）。

值

一个二分 igraph 图。换句话说，一个具有顶点属性 type 的 igraph 图。

详细信息

二分图在 igraph 中具有 ‘type’ 顶点属性，它是布尔值，对于第一类顶点为 FALSE，对于第二类顶点为 TRUE。

graph_from_biadjacency_matrix() 可以以两种模式运行，具体取决于 multiple 参数。如果它是 FALSE，则为二分邻接矩阵中的每个非零元素创建一个边。如果 multiple 为 TRUE，则矩阵元素将向上舍入到最接近的非负整数，以获取要在顶点对之间创建的边数。

一些作者将二分邻接矩阵称为“二分关联矩阵”。 igraph 1.6.0 及更高版本不使用此命名，以避免与边-顶点关联矩阵混淆。

参见

make_bipartite_graph() 用于创建二分图的另一种方法

其他二分邻接：as_data_frame()

作者

Gabor Csardi csardi.gabor@gmail.com

示例


inc <- matrix(sample(0:1, 15, repl = TRUE), 3, 5)
colnames(inc) <- letters[1:5]
rownames(inc) <- LETTERS[1:3]
graph_from_biadjacency_matrix(inc)
#> IGRAPH ccb9f5d UN-B 8 8 -- 
#> + attr: type (v/l), name (v/c)
#> + edges from ccb9f5d (vertex names):
#> [1] A--a A--b A--c A--d A--e B--d C--b C--d