将图转换为邻接矩阵

有时，使用图的标准表示形式（如邻接矩阵）会很有用。

用法

as_adjacency_matrix(
  graph,
  type = c("both", "upper", "lower"),
  attr = NULL,
  edges = deprecated(),
  names = TRUE,
  sparse = igraph_opt("sparsematrices")
)

参数

graph

要转换的图。

type

指定如何为无向图创建邻接矩阵。对于有向图，此参数会被忽略。可能的值：upper：使用矩阵的右上三角部分，lower：使用矩阵的左下三角部分。both：使用整个矩阵，返回对称矩阵。

attr

可以是 NULL 或一个字符串，指定边的属性名称。如果为 NULL，则返回传统的邻接矩阵。如果不是 NULL，则邻接矩阵中会包含给定边属性的值。如果图有多条边，则会包含（对于多条边）任意选择的边的边属性。如果 edges 为 TRUE，则此参数会被忽略。

请注意，这仅适用于某些属性类型。如果 sparse 参数为 TRUE，则属性必须是逻辑值或数值。如果 sparse 参数为 FALSE，则也允许使用字符。 造成这种差异的原因是 Matrix 包尚不支持字符稀疏矩阵。

edges

逻辑标量，指示是否在矩阵中返回边 ID。 对于不存在的边，返回零。

names

逻辑常量，指示是否为矩阵分配行和列名称。 仅当图中存在 name 顶点属性时，才会分配这些名称。

sparse

逻辑标量，指示是否创建稀疏矩阵。 必须安装“Matrix”包才能创建稀疏矩阵。

值

一个 vcount(graph) x vcount(graph)（通常是）数值矩阵。

详细信息

as_adjacency_matrix() 返回图的邻接矩阵。如果 sparse 为 FALSE，则返回常规矩阵；如果 sparse 为 TRUE，则返回稀疏矩阵，如 “Matrix” 包中所定义。

参见

graph_from_adjacency_matrix(), read_graph()

其他转换: as.matrix.igraph(), as_adj_list(), as_biadjacency_matrix(), as_data_frame(), as_directed(), as_edgelist(), as_graphnel(), as_long_data_frame(), graph_from_adj_list(), graph_from_graphnel()

示例

g <- sample_gnp(10, 2 / 10)
as_adjacency_matrix(g)
#> 10 x 10 sparse Matrix of class "dgCMatrix"
#>                          
#>  [1,] . 1 1 . . . . . . .
#>  [2,] 1 . 1 . . . . 1 . .
#>  [3,] 1 1 . . . . . . . .
#>  [4,] . . . . . . . 1 1 .
#>  [5,] . . . . . . . 1 1 .
#>  [6,] . . . . . . . 1 . .
#>  [7,] . . . . . . . 1 . .
#>  [8,] . 1 . 1 1 1 1 . . 1
#>  [9,] . . . 1 1 . . . . .
#> [10,] . . . . . . . 1 . .
V(g)$name <- letters[1:vcount(g)]
as_adjacency_matrix(g)
#> 10 x 10 sparse Matrix of class "dgCMatrix"
#>   [[ suppressing 10 column names ‘a’, ‘b’, ‘c’ ... ]]
#>                      
#> a . 1 1 . . . . . . .
#> b 1 . 1 . . . . 1 . .
#> c 1 1 . . . . . . . .
#> d . . . . . . . 1 1 .
#> e . . . . . . . 1 1 .
#> f . . . . . . . 1 . .
#> g . . . . . . . 1 . .
#> h . 1 . 1 1 1 1 . . 1
#> i . . . 1 1 . . . . .
#> j . . . . . . . 1 . .
E(g)$weight <- runif(ecount(g))
as_adjacency_matrix(g, attr = "weight")
#> 10 x 10 sparse Matrix of class "dgCMatrix"
#>   [[ suppressing 10 column names ‘a’, ‘b’, ‘c’ ... ]]
#>                                                                        
#> a .         0.4678542 0.9239261 .         .         .         .        
#> b 0.4678542 .         0.3161797 .         .         .         .        
#> c 0.9239261 0.3161797 .         .         .         .         .        
#> d .         .         .         .         .         .         .        
#> e .         .         .         .         .         .         .        
#> f .         .         .         .         .         .         .        
#> g .         .         .         .         .         .         .        
#> h .         0.8231206 .         0.7820306 0.8823195 0.3621016 0.8196023
#> i .         .         .         0.2665549 0.2042925 .         .        
#> j .         .         .         .         .         .         .        
#>                                
#> a .         .         .        
#> b 0.8231206 .         .        
#> c .         .         .        
#> d 0.7820306 0.2665549 .        
#> e 0.8823195 0.2042925 .        
#> f 0.3621016 .         .        
#> g 0.8196023 .         .        
#> h .         .         0.8312953
#> i .         .         .        
#> j 0.8312953 .         .