绘制多个 SIR 模型运行的结果 — plot.sir • igraph 网络分析库

此函数可以方便地绘制多个 SIR 模型模拟的结果。

用法

# S3 method for class 'sir'
plot(
  x,
  comp = c("NI", "NS", "NR"),
  median = TRUE,
  quantiles = c(0.1, 0.9),
  color = NULL,
  median_color = NULL,
  quantile_color = NULL,
  lwd.median = 2,
  lwd.quantile = 2,
  lty.quantile = 3,
  xlim = NULL,
  ylim = NULL,
  xlab = "Time",
  ylab = NULL,
  ...
)

参数

x: SIR 模拟的输出，来自 sir() 函数。
comp: 字符标量，指示要绘制的组件。可以是“NI”（感染者，默认值），“NS”（易感者）或“NR”（康复者）。
median: 逻辑标量，指示是否绘制（分箱）中位数。
quantiles: 要绘制的（分箱）分位数向量。
color: 单个模拟曲线的颜色。
median_color: 中位数曲线的颜色。
quantile_color: 分位数曲线的颜色。（如果需要，将循环使用，如果太长，则忽略不需要的条目。）
lwd.median: 中位数的线宽。
lwd.quantile: 分位数曲线的线宽。
lty.quantile: 分位数曲线的线型。
xlim: x 轴限制，一个双元素数值向量。如果为 NULL，则从数据中计算得出。
ylim: y 轴限制，一个双元素数值向量。如果为 NULL，则从数据中计算得出。
xlab: x 轴标签。
ylab: y 轴标签。如果为 NULL，则根据 comp 参数自动添加。
...: 其他参数会传递给 plot()，该函数在添加任何曲线之前运行，以创建图形。

值

无。

详细信息

绘制多个模拟中易感/感染/康复个体数量随时间的变化。

参考文献

Bailey, Norman T. J. (1975). The mathematical theory of infectious diseases and its applications (2nd ed.). London: Griffin.

参见

sir() 用于运行实际模拟。

图上的过程 time_bins()

作者

Eric Kolaczyk (http://math.bu.edu/people/kolaczyk/) 和 Gabor Csardi csardi.gabor@gmail.com.

示例


g <- sample_gnm(100, 100)
sm <- sir(g, beta = 5, gamma = 1)
plot(sm)