图论模体

图论模体是具有明确结构的小型连通诱导子图。这些函数在图中搜索各种模体。

用法

count_motifs(graph, size = 3, cut.prob = NULL)

参数

graph

图对象，输入图。

size

基序的大小。

cut.prob

数值向量，给出在特定级别切割搜索图的概率。它的长度应该与模体的大小（size参数）相同。如果为NULL，则默认情况下不进行切割。

值

count_motifs() 返回一个数值标量。

详细信息

count_motifs() 计算图中给定大小的基序的总数。

参见

isomorphism_class()

其他图基序: dyad_census(), motifs(), sample_motifs()

示例

g <- sample_pa(100)
motifs(g, 3)
#>  [1]  NA  NA 474  NA  90   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0
count_motifs(g, 3)
#> [1] 564
sample_motifs(g, 3)
#> [1] 400