图论模体

图论模体是具有明确结构的小型连通诱导子图。这些函数在图中搜索各种模体。

用法

motifs(graph, size = 3, cut.prob = NULL)

参数

graph

图对象，输入图。

size

模体的大小，目前有向图支持大小为 3 和 4 的模体，无向图支持大小为 3-6 的模体。

cut.prob

数值向量，给出在特定级别切割搜索图的概率。它的长度应该与模体的大小（size参数）相同。如果为NULL，则默认情况下不进行切割。

值

motifs() 返回一个数值向量，表示图中每个模体出现的次数。模体按其同构类排序。请注意，对于不连通的子图，这些子图不被认为是模体，结果将为 NA。

详细信息

motifs() 在图中搜索给定大小的模体，并返回一个数值向量，其中包含不同模体的数量。模体的顺序由它们的同构类定义，请参阅 isomorphism_class()。

参见

isomorphism_class()

其他图模体: count_motifs(), dyad_census(), sample_motifs()

示例

g <- sample_pa(100)
motifs(g, 3)
#>  [1]  NA  NA 504  NA  83   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0
count_motifs(g, 3)
#> [1] 587
sample_motifs(g, 3)
#> [1] 0