图论模体

图论模体是具有明确结构的小型连通诱导子图。这些函数在图中搜索各种模体。

用法

sample_motifs(
  graph,
  size = 3,
  cut.prob = rep(0, size),
  sample.size = NULL,
  sample = NULL
)

参数

graph

图对象，输入图。

size

模体的大小，当前有向图支持大小为3和4，无向图支持大小为3-6。

cut.prob

数值向量，给出在特定级别切割搜索图的概率。它的长度应该与模体的大小（size参数）相同。如果为NULL，则默认情况下不进行切割。

sample.size

用作查找模体起点的顶点数。仅当sample参数为NULL时使用。默认值为ceiling(vcount(graph) / 10)。

sample

如果不是NULL，则指定用作查找模体起点的顶点。

值

一个数值标量，表示图中模体总数的估计值。

详细信息

sample_motifs() 基于样本估计图中给定大小的模体总数。

参见

isomorphism_class()

其他图论模体: count_motifs(), dyad_census(), motifs()

示例

g <- sample_pa(100)
motifs(g, 3)
#>  [1]  NA  NA 401  NA  93   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0
count_motifs(g, 3)
#> [1] 494
sample_motifs(g, 3)
#> [1] 60