自动选择合适的图布局算法

此函数尝试基于一个简单的算法自动为图选择合适的图布局算法。详见下文。

用法

layout_nicely(graph, dim = 2, ...)

nicely(...)

参数

graph

输入图

dim

维度，应为 2 或 3。

...

对于 layout_nicely()，额外的参数会传递给真正的布局函数。对于 nicely()，所有参数都会传递给 layout_nicely()。

值

一个两列或三列的数字矩阵。

详细信息

layout_nicely() 尝试为提供的图选择合适的布局函数，并使用它来生成布局。当前的实现方式如下

1. 如果图有一个名为 ‘layout’ 的图属性，则使用此属性。 如果此属性是一个 R 函数，则会调用它，使用图和任何其他额外参数。

2. 否则，如果图具有名为 ‘x’ 和 ‘y’ 的顶点属性，则将这些用作坐标。 如果图具有额外的 ‘z’ 顶点属性，也会使用该属性。

3. 否则，如果图是一个森林且顶点数少于 30 个，则使用 layout_as_tree()。

4. 否则，如果图是连通的且顶点数少于 1000 个，则通过调用 layout_with_fr() 来使用 Fruchterman-Reingold 布局。

5. 否则，使用 DrL 布局，调用 layout_with_drl()。

在布局算法实现中，一个名为 ‘weights’ 的参数通常用于指定边的权重（如果布局算法支持）。 在这种情况下，省略 ‘weights’ 或将其设置为 NULL 将使 igraph 使用图中的 'weight' 边属性（如果存在）。 但是，大多数布局算法不支持非正权重，因此如果您在未指定显式权重的情况下简单地在图上调用 layout_nicely() 并且权重恰好包含非正数，则 layout_nicely() 将失败。 我们努力确保 layout_nicely() 可以直接用于大多数图，因此规则是，如果您省略 ‘weights’ 或将其设置为 NULL 并且 layout_nicely() 最终会调用 layout_with_fr() 或 layout_with_drl()，我们不会将权重转发给这些函数，并且会发出警告。 您可以使用 weights = NA 来消除警告。

参见

plot.igraph()

其他图布局：add_layout_(), component_wise(), layout_(), layout_as_bipartite(), layout_as_star(), layout_as_tree(), layout_in_circle(), layout_on_grid(), layout_on_sphere(), layout_randomly(), layout_with_dh(), layout_with_fr(), layout_with_gem(), layout_with_graphopt(), layout_with_kk(), layout_with_lgl(), layout_with_mds(), layout_with_sugiyama(), merge_coords(), norm_coords(), normalize()

作者

Gabor Csardi csardi.gabor@gmail.com